При создании модели поверхности в RFEM 6 все поверхности относятся к их центральной поверхности. Толщина отдельных поверхностей учитывается при определении жесткости, но не в геометрии.
Если вы хотите смоделировать плоское соединение двух поверхностей с разной толщиной, необходимо определить эксцентриситет поверхности.