Наиболее вероятная причина разных результатов заключается в том, что вы не установили одинаковое сглаживание внутренних сил поверхности.
Это можно установить отдельно в RFEM 6 и в аддоне.
Сглаживание результатов в RFEM 6 Параметры сглаживания для расчета напряжений-деформацийЕсли сглаживание в обоих настройках одинаковое, то и напряжения одинаковы.