Před výpočtem je potřeba vygenerovat síť konečných prvků. RFEM vytvoří 1D prvky pro pruty, 2D prvky pro desky, stěny a skořepiny a v případě potřeby 3D prvky pro tělesa. Konstrukce se tak pro analýzu rozloží na malé dílčí části - konečné prvky. Pro každý prvek jsou sestaveny podmínky rovnováhy, které vedou k lineárnímu systému rovnic s velkým počtem neznámých. Čím jemnější je síť konečných prvků, tím více bodů je k dispozici pro analýzu konečných prvků. Přitom však současně stoupají požadavky na výpočetní čas, neboť se musí zpracovat větší množství dat. Pro každý další uzel sítě je třeba řešit další rovnice.
Síť konečných prvků se generuje automaticky. Existuje však několik možností, jak nastavit vlastnosti sítě.